AIMBE Fellow 潘毅：少年状元、九年学术荒，拒做生(3)-电子与信息学报

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AIMBE Fellow 潘毅：少年状元、九年学术荒，拒做生(3)

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对别的生物学家来说，在研究中没有合适的工具或许是无法逾越的难题，但学计算机出身的潘毅却可以自己制作工具。

即便做了16年的系主任，行政工作繁忙，潘毅依旧时常与生物信息学领域的华人学者们互相交流学习。

作者注：

潘毅最初进行序列对比工作时，最常见的DNA替换积分矩阵和蛋白质替换积分矩阵是等价矩阵（unitary matrix）。

沈美明教授对潘毅更是慷慨解囊。潘毅表示，“我出国留学前手头没有美金，还是沈老师借了钱给我解燃眉之急。”

“这是一条非常崎岖的道路。”潘毅这样形容自己从计算机转型做生物信息学的选择。

潘毅回忆道：“金兰教授已经年迈，但他每年都要发几篇英文的文章，随时记录自己的想法，这种认真刻苦的作风让我印象十分深刻，也给了我很多的鼓励，让我养成了好的学术作风。”

就在徐鹰、许东两位教授回到学校不久后，潘毅也开始探索生物信息领域。

“潘老师不仅是我的学术导师，更是人生导师。”雷秀娟向雷峰网《医健AI掘金志》介绍，她前往佐治亚州立大学学习时，潘毅已经是全球知名的科学家、院士，依旧会花大量时间指导学生的科研工作，从论文思路到框架、内容、表达、图表等等，精益求精。

潘毅与李明、王建新两位教授以及图灵奖获得者John Hopcroft共同出席ISBRA 2014??

在技术发生变革的同时，潘毅的研究也逐渐进入第二阶段。

人到中年，进入一个完全陌生的领域并不是件容易事。

和不少生物信息学领域的学者一样，潘毅也是一位计算机专业出身的跨学科研究者。

其次是心理上的落差。在计算机行业内已经成名的潘毅，要进入生物信息领域，只能和所有新人一样从底层开始一步步向上走。

基因调控网络的研究如今已被广泛应用于疾病基因预测、药物靶标的筛选等领域，并对疾病早期诊断、个性化治疗、药物研究产生了深远影响。

除此之外，还有研究中遇到的最重要的难题：与生物学家合作中的矛盾。

成为一个优秀管理者的背后，是无数不为人知的苦功。

在美国密苏里大学担任了多年系主任的许东对雷峰网《医健AI掘金志》说：“潘毅教授是一位非常成功的管理者。”

在生物网络分析的研究中，要通过生物实验数据挖掘出生物网络的潜在变化，以系统的方法研究生命现象的热点和难点，主要包括蛋白质调控网络与基因调控网络。

因此，对于一个已知序列但是结构和功能都未知的蛋白质，如果与它相似的序列的结构和功能是已知的，就据此可以推测出未知蛋白质的结构和功能。

在清华大学这个“红色工程师的摇篮”中学习成长，年轻的潘毅和他的同学们都以能进入国企成为一名工程师为荣。

硕士期间，潘毅在由金兰、郑纬民、沈美明和王鼎兴几位老教授组成的教研组内学习，导师金兰教授是清华大学计算机专业最早的一批老师，亲历了计算机专业的创建。

于是，他与一位对计算机领域较为了解的生物学教授合作，申请了一笔一百五十万美元的科研经费，组建起佐治亚州立大学生物信息学研究的初始团队。

只是，作为团队的领导者，潘毅面临的难题还远不止如此。

进行序列对比的目的是寻找不同序列之间的相似性。相似的序列往往起源于共同的祖先，可能有相似的结构和相似的生物学功能。

“我始终对学生讲，研究问题不仅仅要关注AI，还要将AI的算法与实际问题相结合，从实践中来到实践中去，这样的算法既有理论的高度又有落地的基础，才有顶天立地的效果。”

选择出国留学，则使他的人生增添了许多的不确定性。

攻读了两年博士后，由于导师决定定居国外，潘毅最终放弃留校，并于1986年经清华大学的允许前往加拿大卡尔加里大学。1987年1月份，潘毅转到美国著名高等学府，也是美国最早的十所大学之一——匹兹堡大学计算机科学系重新开始攻读博士学位。

2022年，深理工的首届联合培养硕士研究生毕业，100%实现就业升学。

但是，身处国家风云巨变的时代，继成为恢复高考后的第一批大学生后，又赶上了国家放开出国留学政策，潘毅走上了一条意料之外的道路。

出国以前，他是江苏省的理科高考状元，是恢复高考后的第一届大学生，是国内顶尖学府清华大学的天之骄子，即便面A临着优秀的同窗们带来的竞争压力，但他未来的人生仍是清晰可见的一片坦途。

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